São poderes da CBDA:

a) Assembleia Geral;

b) Presidência;

c) Diretoria;

d) Conselho Fiscal;

e) Superior Tribunal de Justiça Desportiva;

f) Conselho de Administração.

São órgãos de cooperação, o Conselho Técnico Nacional de Natação, de Polo Aquático, de Nado Artístico, de Saltos Ornamentais de Águas Abertas, bem como o Conselho Nacional dos Atletas;

Constituem unidades autônomas e independentes, a Comissão Disciplinar - CD e o Superior Tribunal de Justiça Desportiva – STJD.